巫溪县疾病预防控制中心是在巫溪县卫生与健康委员会领导下的全民事业单位，是在原巫溪县卫生防疫站基础上于2003年4月组建而成。
中心占地面积1650平方米，中心办公大楼占地650平方米，建筑面积2660平方米。赵家坝设有900平方米疾控门诊。中心现有编制数62，在编人员32名，其中高级职称4人，中级职称3人，初级职称21人，行政职员岗4人；临聘人员15人，共有职工47人。中心拥有检验检测仪器设备125台。建有综合门诊和艾滋病初筛实验室。通过重庆市技术监督局、市卫生局认证，取得了实验室计量认证合格证，2015年通过职业卫生丙级资质评审，为社会出具法律效力的检测数据。建立了一支相对稳定、功能齐全、反应迅速、网络完善的突发公共卫生事件应急处理队伍，对重大疫情、中毒和灾害性等公共卫生突发事件的应急处理能力显著提高。