卓仁堂的中医体系，遵循古中医第一书《黄帝内经》来搭建，包含药饮、针灸、砭痧，推拿，导引五大类治疗方法。摆脱大众对“中医就是喝中药”的死板概念，构建“ 内病外治”“外病内治”“内外同治”的立体治疗体系，对患者全身的问题进行诊断，梳理和治疗。
同时，在“治疗全身”的基础上，卓仁堂的调理也涵盖“各年龄段的全生”，从小儿推拿到青年亚健康，从中年症候到老年养生，都是卓仁堂所覆盖的范围。